Added the header for documentation to all .py files master
authorAntonio Jimenez Pastor <antonio@ebook.dk-compmath.jku.at>
Tue, 16 Jul 2019 15:26:24 +0000 (17:26 +0200)
committerAntonio Jimenez Pastor <antonio@ebook.dk-compmath.jku.at>
Tue, 16 Jul 2019 15:26:24 +0000 (17:26 +0200)
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all the files created by me.

40 files changed:
ajpastor/__init__.py
ajpastor/dd_functions/__init__.py
ajpastor/dd_functions/ddExamples.py
ajpastor/dd_functions/lazyDDRing.py
ajpastor/dd_functions/symbolic.py
ajpastor/dd_functions/toDiffAlgebraic.py
ajpastor/lazy/__init__.py
ajpastor/lazy/conversion.py
ajpastor/lazy/lazyFracField.py
ajpastor/lazy/lazyIDElements.py
ajpastor/lazy/lazyRing.py
ajpastor/lazy/lazyToPoly.py
ajpastor/misc/__init__.py
ajpastor/misc/bareiss.py
ajpastor/misc/dinamic_string.py
ajpastor/misc/exceptions.py
ajpastor/misc/matrix.py
ajpastor/misc/restore.py
ajpastor/misc/ring_w_sequence.py
ajpastor/misc/sequence_manipulation.py
ajpastor/misc/verbose.py
ajpastor/operator/__init__.py
ajpastor/operator/directStepOperator.py
ajpastor/operator/fullLazyOperator.py
ajpastor/operator/lazyStepOperator.py
ajpastor/operator/listOperator.py
ajpastor/operator/operator.py
ajpastor/operator/oreOperator.py
ajpastor/operator/polynomialLazyOperator.py
ajpastor/operator/twoStepsOperator.py
ajpastor/tests/__init__.py
ajpastor/tests/dd_functions/__init__.py
ajpastor/tests/dd_functions/base_test.py
ajpastor/tests/dd_functions/bessel.py
ajpastor/tests/dd_functions/chebyshev.py
ajpastor/tests/dd_functions/ddFunction.py
ajpastor/tests/dd_functions/ddFunction2.py
ajpastor/tests/dd_functions/examples.py
ajpastor/tests/dd_functions/hypergeometric.py
ajpastor/tests/dd_functions/identities.py

index 6e3977c..758d6cf 100644 (file)
@@ -1,2 +1,28 @@
+r"""
+Package ajpastor
+
+In this package the user may find the following subpackages:
+* dd_functions: implementation of DDFunctions
+* operator: implementation of linear differential operators
+* lazy: implementation of lazy systems in Sage
+* misc: implementation of several miscellaneous utilities
+* tests: provide several tests 
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
+
 from pkgutil import extend_path;
 __path__ = extend_path(__path__, __name__);
index 66d2738..df5e43c 100644 (file)
@@ -1,3 +1,29 @@
+r"""
+Package dd_functions
+
+In this package the user may find the following subpackages:
+* ddFunctions: ddFunctions and ddRings
+* ddExamples: examples of DDFunctions
+* symbolic: code for treating with Symbolic Expressions
+* toDiffAlgebraic: include methods for treat with algebraic properties of DDFunctions
+* lazyDDRing: and implementation of a DDRing with lazy elements
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
+
 try:
     from .ddFunction import *
 except Exception:
index a71ea22..f1ba817 100644 (file)
@@ -1,3 +1,100 @@
+r"""
+Python file for DD-examples
+
+With this package the user has access to many special functions with the DDFunction structure.
+Here we describe the functions available in this module. For further information on each function, 
+please access the documentation for that particular function.
+        
+All the elements that are returned in this module are DDFunction, i.e.,
+formal power series defined with a linear differential equation and
+some appropriate initial values.
+        
+When possible, the functions returned by this module are associated with
+the usual implementation of those functions in SAGE, so using the 
+method "to_symbolic()" returns the same object in the Symbolic Ring.
+        
+The functions available in this module are the following:
+        
+* TRIGONOMETRIC FUNCTIONS
+       - Sin
+       - Cos
+       - Tan
+       - Sinh
+       - Cosh
+       - Tanh
+       - Arcsin
+       - Arccos
+       - Arctan
+       - Arcsinh
+       - Arccosh
+       - Arctanh
+* EXPONENTIAL FUNCTIONS
+       - Exp
+       - Log
+       - Log1
+* BESSEL TYPE FUNCTIONS (see chapters 10, 11 in https://dlmf.nist.gov)
+       - BesselD
+       - StruveD
+* ORTHOGONAL POLRNOMAILS
+       - LegendreD (see chapter 14 in https://dlmf.nist.gov)
+       - ChebyshevD (see chapter 18 in https://dlmf.nist.gov)
+* HYPERGEOMETRIC FUNCTIONS (see chapters 15, 16 in https://dlmf.nist.gov)
+       - HypergeometricFunction
+       - GenericHypergeometricFunction
+       - Polylogarithms (see section 25.12 in https://dlmf.nist.gov)
+* RICCATI EQUATION (see https://en.wikipedia.org/wiki/Riccati_equation)
+       - RiccatiD
+* MATHIEU TYPE FUNCTIONS (see chapter 28 in https://dlmf.nist.gov)
+       - MathieuD
+       - MathieuSin
+       - MathieuCos
+       - MathieuH
+       - MathieuSinh
+       - MathieuCosh
+       - HillD
+* AIRY'S FUNCTIONS
+       - AiryD
+* PARABOLIC-CYLINDER TYPE FUNCTIONS
+       - ParabolicCylinderD
+* ELLIPTIC INTEGRALS (see chapter 19 in https://dlmf.nist.gov)
+       - EllipticLegendreD
+* SPHEROIDAL WAVE FUNCTIONS (see chapter 30 in https://dlmf.nist.gov)
+       - CoulombSpheroidalFunctionD
+       - SpheroidalWaveFunctionD
+* HEUN'S FUNCTIONS (see chapter 31 in https://dlmf.nist.gov)
+       - FuschianD
+       - HeunD
+* COULOMB WAVE FUNCTION (see chapter 33 in https://dlmf.nist.gov)
+       - CoulombF
+            
+* COMBINATORIAL FUNCTIONS
+       - Catalan
+       - Fibonacci
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.dd_functions import *
+       sage: Exp(x).getInitialValueList(10) == [1]*10
+       True
+
+TODO::
+       * Improve the Examples section of this doc
+       * Improve the documentation of the functions in this package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
@@ -11,87 +108,6 @@ from ajpastor.misc.dinamic_string import *;
 
 from ajpastor.misc.exceptions import *;
 
-def ddExamples_log(functions = False, names=False):
-    r'''
-        Welcome to ddExamples documentation. Here we describe the functions
-        available in this module. For further information on each function, 
-        please access the documentation for that particular function.
-        
-        All the elements that are returned in this module are DDFunction, i.e.,
-        formal power series defined with a linear differential equation and
-        some appropriate initial values.
-        
-        When possible, the functions returned by this module are associated with
-        the usual implementation of those functions in SAGE, so using the 
-        method "to_symbolic()" returns the same object in the Symbolic Ring.
-        
-        The functions available in this module are the following:
-        
-        ** TRIGONOMETRIC FUNCTIONS
-            - Sin
-            - Cos
-            - Tan
-            - Sinh
-            - Cosh
-            - Tanh
-            - Arcsin
-            - Arccos
-            - Arctan
-            - Arcsinh
-            - Arccosh
-            - Arctanh
-        ** EXPONENTIAL FUNCTIONS
-            - Exp
-            - Log
-            - Log1
-        ** BESSEL TYPE FUNCTIONS (see chapters 10, 11 in https://dlmf.nist.gov)
-            - BesselD
-            - StruveD
-        ** ORTHOGONAL POLRNOMAILS
-            - LegendreD (see chapter 14 in https://dlmf.nist.gov)
-            - ChebyshevD (see chapter 18 in https://dlmf.nist.gov)
-        ** HYPERGEOMETRIC FUNCTIONS (see chapters 15, 16 in https://dlmf.nist.gov)
-            - HypergeometricFunction
-            - GenericHypergeometricFunction
-            - Polylogarithms (see section 25.12 in https://dlmf.nist.gov)
-        ** RICCATI EQUATION (see https://en.wikipedia.org/wiki/Riccati_equation)
-            - RiccatiD
-        ** MATHIEU TYPE FUNCTIONS (see chapter 28 in https://dlmf.nist.gov)
-            - MathieuD
-            - MathieuSin
-            - MathieuCos
-            - MathieuH
-            - MathieuSinh
-            - MathieuCosh
-            - HillD
-        ** AIRY'S FUNCTIONS
-            - AiryD
-        ** PARABOLIC-CYLINDER TYPE FUNCTIONS
-            - ParabolicCylinderD
-        ** ELLIPTIC INTEGRALS (see chapter 19 in https://dlmf.nist.gov)
-            - EllipticLegendreD
-        ** SPHEROIDAL WAVE FUNCTIONS (see chapter 30 in https://dlmf.nist.gov)
-            - CoulombSpheroidalFunctionD
-            - SpheroidalWaveFunctionD
-        ** HEUN'S FUNCTIONS (see chapter 31 in https://dlmf.nist.gov)
-            - FuschianD
-            - HeunD
-        ** COULOMB WAVE FUNCTION (see chapter 33 in https://dlmf.nist.gov)
-            - CoulombF
-            
-        ** COMBINATORIAL FUNCTIONS
-            - Catalan
-            - Fibonacci
-    '''
-    if(not functions):
-        print ddExamples.__doc__;
-    else:
-        funcs =  [Sin,Cos,Tan,Sinh,Cosh,Exp,Log,Log1,BesselD,StruvD,LegendreD,ChebyshevD,HypergeometricFunction,GenericHypergeometricFunction,MathieuD,MathieuSin,MathieuCos,ModifiedMathieuD,ModifiedMathieuSin,ModifiedMathieuCos,HillD,AiryD,ParabolicCylinderD,EllipticLegendreD,CoulombSpheroidalFunctionD,SpheroidalWaveFunctionD,FuschianD,HeunD,CoulombF];
-        
-        if(names):
-            return [el.__name__ for el in funcs];
-        return funcs;
-
 ##################################################################################
 ##################################################################################
 ###
@@ -105,13 +121,13 @@ def Sin(input, ddR = None):
         D-finite implementation of the Sine function (sin(x)).
            
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/Sine.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Sine
+       - http://mathworld.wolfram.com/Sine.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Sine
                 
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
                 
         This function can be converted into symbolic expressions.
         
@@ -149,13 +165,13 @@ def Cos(input, ddR = None):
         D-finite implementation of the Cosine function (cos(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/Cosine.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Cosine
+       - http://mathworld.wolfram.com/Cosine.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Cosine
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -182,13 +198,13 @@ def Tan(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the Tangent function (tan(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/Tangent.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Tangent
+       - http://mathworld.wolfram.com/Tangent.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Tangent
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -233,13 +249,13 @@ def Sinh(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the Hyperbolic Sine function (sinh(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/HyperbolicSine.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Hyperbolic_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/HyperbolicSine.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Hyperbolic_function
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -266,13 +282,13 @@ def Cosh(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the Hyperbolic Cosine function (cosh(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/HyperbolicCosine.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Hyperbolic_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/HyperbolicCosine.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Hyperbolic_function
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -299,13 +315,13 @@ def Tanh(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the Tangent hyperbolic function (tanh(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/HyperbolicTangent.html 
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Hyperbolic_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/HyperbolicTangent.html 
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Hyperbolic_function
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -350,13 +366,13 @@ def Arcsin(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the Arcsine function (arcsin(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/InverseSine.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Inverse_trigonometric_functions
+       - http://mathworld.wolfram.com/InverseSine.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Inverse_trigonometric_functions
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -400,13 +416,13 @@ def Arccos(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the Arccosine function (arccos(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/InverseCosine.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Inverse_trigonometric_functions
+       - http://mathworld.wolfram.com/InverseCosine.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Inverse_trigonometric_functions
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -451,13 +467,13 @@ def Arctan(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the Arctangent function (arctan(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/InverseTangent.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Inverse_trigonometric_functions
+       - http://mathworld.wolfram.com/InverseTangent.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Inverse_trigonometric_functions
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -501,13 +517,13 @@ def Arcsinh(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the hyperbolic Arcsine function (arcsinh(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/InverseHyperbolicSine.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Inverse_hyperbolic_functions
+       - http://mathworld.wolfram.com/InverseHyperbolicSine.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Inverse_hyperbolic_functions
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -550,13 +566,13 @@ def Arccosh(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the hyperbolic Arccosine function (arccosh(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/InverseHyperbolicCosine.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Inverse_hyperbolic_functions
+       - http://mathworld.wolfram.com/InverseHyperbolicCosine.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Inverse_hyperbolic_functions
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -601,13 +617,13 @@ def Arctanh(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the hyperbolic Arctangent function (arctanh(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/InverseHyperbolicTangent.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Inverse_hyperbolic_functions
+       - http://mathworld.wolfram.com/InverseHyperbolicTangent.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Inverse_hyperbolic_functions
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression with x as a factor.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must be divisible by the main variable.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -657,13 +673,13 @@ def Log(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the Logarithm function (ln(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/Logarithm.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Logarithm
+       - http://mathworld.wolfram.com/Logarithm.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Logarithm
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression such the evaluation x=0 gives 1.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must evaluate to 1 when the main variable is 0.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 1.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression such the evaluation x=0 gives 1.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must evaluate to 1 when the main variable is 0.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 1.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -690,13 +706,13 @@ def Log1(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the shifted Logarithm function (ln(x+1)). It is equivalent to Log(input+1).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/Logarithm.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Logarithm
+       - http://mathworld.wolfram.com/Logarithm.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Logarithm
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression such the evaluation x=0 gives 0.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must evaluate to 0 when the main variable is 0.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression such the evaluation x=0 gives 0.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must evaluate to 0 when the main variable is 0.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -725,13 +741,13 @@ def Exp(input, ddR = None):
         DD-finite implementation of the Exponential function (exp(x)).
         
         References:
-            - http://mathworld.wolfram.com/ExponentialFunction.html
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Exponential_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/ExponentialFunction.html
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Exponential_function
             
         This functions allows the user to fix the argument. The argument can be:
-            - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression such the evaluation x=0 gives 0.
-            - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must evaluate to 0 when the main variable is 0.
-            - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
+       - A symbolic expression: all variables but "x" will be considered as parameters. Must be a polynomial expression such the evaluation x=0 gives 0.
+       - A polynomial: the first generator of the polynomial ring will be considered the variable to compute derivatives and the rest will be considered as parameters. The polynomial must evaluate to 0 when the main variable is 0.
+       - A DDFunction: the composition will be computed. The DDFunction must have initial value 0.
             
         This function can be converted into symbolic expressions.
     '''
@@ -764,22 +780,22 @@ def BesselD(input = 'P', kind = 1):
         DD-finite implementation of the Bessel functions (J_n(x), Y_n(x)).
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/10.2
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Bessel_function
-            - http://mathworld.wolfram.com/BesselFunction.html
+       - https://dlmf.nist.gov/10.2
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Bessel_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/BesselFunction.html
             
         This method returns a function in the appropriate DD-Ring satisfying the differential equation
             x^2 f'' + xf' + (x^2-P^2)f = 0
         where 'x' is the variable and 'P' is a constant parameter (i.e. P' = 0).
         
         INPUT:
-            - input: the parameter 'n' for the Bessel differential equation. Currently, only non-negative integer are allowed. If no value is given, then the symbolic Bessel function (only with an equation) is returned with parameter "P". The input can also be a string with a name for the parameter or a polynomial expression involving parameters.
-            - kind: the kind of bessel function the user want to get (default 1). It can take tha values 1 or 2. Currently, only the first kind is fully implemented.
+       - input: the parameter 'n' for the Bessel differential equation. Currently, only non-negative integer are allowed. If no value is given, then the symbolic Bessel function (only with an equation) is returned with parameter "P". The input can also be a string with a name for the parameter or a polynomial expression involving parameters.
+       - kind: the kind of bessel function the user want to get (default 1). It can take tha values 1 or 2. Currently, only the first kind is fully implemented.
         
         WARNING:
-            - For power series solution this function only have non-zero solutions when the argument 'input' is a non-negative integer. Hence, initial values will also be computed for the parameter values that have power series solutions.
-            - The implementation will say that the symbolic Bessel function is the zero function for non-negative values of the parameter. In any case, the method 'to_symbolic' will return the appropriate SAGE function.
-            - When evaluating parameters, the initial values will not update and must be set by hand.
+       - For power series solution this function only have non-zero solutions when the argument 'input' is a non-negative integer. Hence, initial values will also be computed for the parameter values that have power series solutions.
+       - The implementation will say that the symbolic Bessel function is the zero function for non-negative values of the parameter. In any case, the method 'to_symbolic' will return the appropriate SAGE function.
+       - When evaluating parameters, the initial values will not update and must be set by hand.
     '''
     parent, par = __check_list([input], DFinite.variables());
     par = par[0];
@@ -810,9 +826,9 @@ def StruveD(mu='P',kind=1):
         DD-finite implementation of the Struve functions (J_n(x), Y_n(x)).
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/11.2
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Struve_function
-            - http://mathworld.wolfram.com/StruveFunction.html
+       - https://dlmf.nist.gov/11.2
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Struve_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/StruveFunction.html
             
         Struve functions are the solutions for the inhomogeneous Bessel differential equation
         and have also a parameter 'P' involved:
@@ -828,13 +844,13 @@ def StruveD(mu='P',kind=1):
         coefficients, we work with the function f_mu(x) = pi*H_mu(x).
         
         INPUT:
-            - input: the parameter 'mu' for the Struve differential equation. Currently, only integers greater than -2 are allowed. If 'None' is given, then the symbolic Struve function (only with an equation) is returned with parameter "P". The input can also be a string with a name for the parameter or a polynomial expression involving parameters.
-            - kind: the kind of Struve function the user want to get (default 1). It can take the values 1 or 2. Currently, only the first kind is fully implemented.
+       - input: the parameter 'mu' for the Struve differential equation. Currently, only integers greater than -2 are allowed. If 'None' is given, then the symbolic Struve function (only with an equation) is returned with parameter "P". The input can also be a string with a name for the parameter or a polynomial expression involving parameters.
+       - kind: the kind of Struve function the user want to get (default 1). It can take the values 1 or 2. Currently, only the first kind is fully implemented.
         
         WARNING:
-            - Initial values will also be computed for the parameter values that have power series solutions.
-            - The implementation will say that the symbolic Bessel function is the zero function for non-negative values of the parameter. In any case, the method 'to_symbolic' will return the appropriate SAGE function.
-            - When evaluating parameters, the initial values will not update and must be set by hand.
+       - Initial values will also be computed for the parameter values that have power series solutions.
+       - The implementation will say that the symbolic Bessel function is the zero function for non-negative values of the parameter. In any case, the method 'to_symbolic' will return the appropriate SAGE function.
+       - When evaluating parameters, the initial values will not update and must be set by hand.
         
     '''
     parent, par = __check_list([mu], DFinite.variables());
@@ -889,9 +905,9 @@ def LegendreD(nu='n', mu = 0, kind=1):
         D-finite implementation of the Legendre functions (P_n(x) and Q_n(x))
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/18.3 & https://dlmf.nist.gov/14.2
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Legendre_polynomials
-            - http://mathworld.wolfram.com/LegendrePolynomial.html & http://mathworld.wolfram.com/LegendreFunctionoftheSecondKind.html
+       - https://dlmf.nist.gov/18.3 & https://dlmf.nist.gov/14.2
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Legendre_polynomials
+       - http://mathworld.wolfram.com/LegendrePolynomial.html & http://mathworld.wolfram.com/LegendreFunctionoftheSecondKind.html
             
         Legendre functions are the solutions to the differential equation:
             (1-x^2)f'' - 2xf' + n(n+1)f = 0
@@ -916,13 +932,13 @@ def LegendreD(nu='n', mu = 0, kind=1):
         Legendre differential equation. 
         
         INPUT:
-            - nu: the parameter 'n' on the assocaited differential equation. If not provided, ot takes the value 'n' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - mu: the parameter 'm' on the assocaited differential equation. If not provided, ot takes the value 0 by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - kind: the kind of the Legendre function the user want to get. It can take the values 1 and 2 (1 by default).
+       - nu: the parameter 'n' on the assocaited differential equation. If not provided, ot takes the value 'n' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - mu: the parameter 'm' on the assocaited differential equation. If not provided, ot takes the value 0 by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - kind: the kind of the Legendre function the user want to get. It can take the values 1 and 2 (1 by default).
             
         WARNING:
-            - Initial values will also be computed for the parameter values that have power series solutions. The second kind may have non-rational initial values and those will not be computed.
-            - When evaluating parameters, the initial values will not update and must be set by hand.
+       - Initial values will also be computed for the parameter values that have power series solutions. The second kind may have non-rational initial values and those will not be computed.
+       - When evaluating parameters, the initial values will not update and must be set by hand.
     '''
     parent, par = __check_list([nu,mu], DFinite.variables());
     n = par[0]; m = par[1];
@@ -969,9 +985,9 @@ def ChebyshevD(input='n', kind = 1, poly=True):
         D-finite implementation of the Chebyshev polynomials (T_n(x), U_n(x))
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/18.3
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Chebyshev_polynomials
-            - http://mathworld.wolfram.com/ChebyshevPolynomialoftheFirstKind.html & http://mathworld.wolfram.com/ChebyshevPolynomialoftheSecondKind.html
+       - https://dlmf.nist.gov/18.3
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Chebyshev_polynomials
+       - http://mathworld.wolfram.com/ChebyshevPolynomialoftheFirstKind.html & http://mathworld.wolfram.com/ChebyshevPolynomialoftheSecondKind.html
             
         The Chebyshev polynomials of the first kind T_n(x) are the polynomial solutions 
         to the differential equation
@@ -999,13 +1015,13 @@ def ChebyshevD(input='n', kind = 1, poly=True):
         Chebyshev differential equation. 
         
         INPUT:
-            - input: the parameter 'n' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'n' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - kind: the kind of the Chebyshev polynomials the user want to get. It can take the values 1, 2, 3 and 4 (1 by default).
-            - poly: a boolean value that refer to the polynomial solution to the differential equation or the other power series solution. If False, the other power serie solution will be returned such that the Wronskian of this solution with the polynomial solution is 1. NOTE: when the parameter is not an integer, this parameter only makes a difference in the name of the function, adding a "P_" at the beginning.
+       - input: the parameter 'n' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'n' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - kind: the kind of the Chebyshev polynomials the user want to get. It can take the values 1, 2, 3 and 4 (1 by default).
+       - poly: a boolean value that refer to the polynomial solution to the differential equation or the other power series solution. If False, the other power serie solution will be returned such that the Wronskian of this solution with the polynomial solution is 1. NOTE: when the parameter is not an integer, this parameter only makes a difference in the name of the function, adding a "P_" at the beginning.
             
         WARNING:
-            - Initial values will also be computed for the integer parameter values.
-            - When evaluating parameters, the initial values will not update and must be set by hand.
+       - Initial values will also be computed for the integer parameter values.
+       - When evaluating parameters, the initial values will not update and must be set by hand.
     '''
     parent, par = __check_list([input], DFinite.variables());
     n = par[0];
@@ -1067,9 +1083,9 @@ def HypergeometricFunction(a='a',b='b',c='c', init = 1):
         D-finite implementation of the Gauss Hypergeometric function
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/15
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Hypergeometric_function
-            - http://mathworld.wolfram.com/HypergeometricFunction.html
+       - https://dlmf.nist.gov/15
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Hypergeometric_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/HypergeometricFunction.html
             
         The Gauss Hypergeometric function is a special function represented by the hypergeometric 
         series, that includes many other special functions as specific or limiting cases. It is a 
@@ -1084,10 +1100,10 @@ def HypergeometricFunction(a='a',b='b',c='c', init = 1):
         to GenericHypergeometricFunction([a,b],[c],init).
         
         INPUT:
-            - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - b: the parameter 'b' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'b' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - c: the parameter 'c' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'c' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - init: the initial value of the hypergeometric function. It is the first value of the hypergeometric sequence. If not provided, it takes the value 1 by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - b: the parameter 'b' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'b' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - c: the parameter 'c' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'c' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - init: the initial value of the hypergeometric function. It is the first value of the hypergeometric sequence. If not provided, it takes the value 1 by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
     '''
     return GenericHypergeometricFunction([a,b],[c],init);
 
@@ -1096,9 +1112,9 @@ def GenericHypergeometricFunction(num=[],den=[],init=1):
         D-finite implementation of the Generalized Hypergeometric Functions qFp(a_1,...,a_q;b_1,...,b_m;x)
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/16
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Generalized_hypergeometric_function
-            - http://mathworld.wolfram.com/GeneralizedHypergeometricFunction.html
+       - https://dlmf.nist.gov/16
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Generalized_hypergeometric_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/GeneralizedHypergeometricFunction.html
             
         The Generic Hypergeometric function is a special function denoted by qFp(a_1,...,a_p;b_1,...,b_q;x) represented 
         by the hypergeometric series
@@ -1110,9 +1126,9 @@ def GenericHypergeometricFunction(num=[],den=[],init=1):
             (D(D+b_1-1)...(D+b_q-1) - x(D+a_1)...(D+a_p))(f) = 0
                 
         INPUT:
-            - num: a list with the parameters "a_i". It also can be just one element that will be consider as a list with that element. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - den: a list with the parameters "b_i". It also can be just one element that will be consider as a list with that element. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - init: the initial value of the hypergeometric function. It is the first value of the hypergeometric sequence. If not provided, it takes the value 1 by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - num: a list with the parameters "a_i". It also can be just one element that will be consider as a list with that element. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - den: a list with the parameters "b_i". It also can be just one element that will be consider as a list with that element. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - init: the initial value of the hypergeometric function. It is the first value of the hypergeometric sequence. If not provided, it takes the value 1 by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
     '''
     ## Checking arguments: num
     if (not (isinstance(num,list) or isinstance(num,set) or isinstance(num,tuple))):
@@ -1180,15 +1196,15 @@ def PolylogarithmD(s=1):
         Implementation using DDFunctions of the Polylogarithms
 
         References:
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Polylogarithm
-            - http://mathworld.wolfram.com/Polylogarithm.html
-            - https://dlmf.nist.gov/25.12
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Polylogarithm
+       - http://mathworld.wolfram.com/Polylogarithm.html
+       - https://dlmf.nist.gov/25.12
 
         The s-Polylogarithm is the power series defined with the sequence (1/n^s) for n >= 0. It can be computed
         recursively using and integral formula using the (s-1)-Polylogarithm.
 
         INPUT:
-            - s: Integer and positive value. All other possible powers are not accepted so far.
+       - s: Integer and positive value. All other possible powers are not accepted so far.
     '''
     if((not (s in ZZ)) or s < 1):
         raise ValueError("The parameter 's' must be a positive integer. Got %d" %s);
@@ -1213,7 +1229,7 @@ def RiccatiD(a,b,c,init=None, ddR = None, full = False, name="w"):
         Implementation using DDFunctions of the solutions for the Ricatti differential equation.
         
         References:
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Riccati_equation
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Riccati_equation
             
         The Riccati differential equation is a non-linear differential equation of order one of the shape
             u' = a + bu + cu^2
@@ -1226,13 +1242,13 @@ def RiccatiD(a,b,c,init=None, ddR = None, full = False, name="w"):
         Given the initial condition u(0) is enough to determined all the coefficients of the solution.
         
         INPUT:
-            - a: function to represent the constant term in the quadratic polynomial that is the derivative of u(x)
-            - b: function to represent the linear term in the quadratic polynomial that is the derivative of u(x)
-            - c: function to represent the leading term in the quadratic polynomial that is the dericative of u(x)
-            - init: initial condition u(0) of the solution. None is also valid
-            - ddR: basic DDRing where to put all the inputs a,b,c if they are not DDFunctions
-            - full: if True, it returns also the function w used to build the solution in a tuple (solution, w)
-            - name: name the system will give to the function w. By default this is "w"
+       - a: function to represent the constant term in the quadratic polynomial that is the derivative of u(x)
+       - b: function to represent the linear term in the quadratic polynomial that is the derivative of u(x)
+       - c: function to represent the leading term in the quadratic polynomial that is the dericative of u(x)
+       - init: initial condition u(0) of the solution. None is also valid
+       - ddR: basic DDRing where to put all the inputs a,b,c if they are not DDFunctions
+       - full: if True, it returns also the function w used to build the solution in a tuple (solution, w)
+       - name: name the system will give to the function w. By default this is "w"
     '''
     ## Considering the three parameters
     from sage.categories.pushout import pushout;
@@ -1273,9 +1289,9 @@ def MathieuD(a='a',q='q',init=()):
         DD-finite implementation of the Matheiu function
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/28.2
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Mathieu_function
-            - http://mathworld.wolfram.com/MathieuFunction.html
+       - https://dlmf.nist.gov/28.2
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Mathieu_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/MathieuFunction.html
             
         The Mathieu functions are the solutions to the DD-finite differential equation
             f'' + (a - 2qcos(2x))f = 0.
@@ -1284,9 +1300,9 @@ def MathieuD(a='a',q='q',init=()):
         sine and cosine (for q=0, a=1), and have several physical aplications.
         
         INPUT:
-            - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - q: the parameter 'q' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'q' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - q: the parameter 'q' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'q' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
     '''
     parent, new_all = __check_list([a,q] + list(init), [str(el) for el in DFinite.variables()]);
     ra = new_all[0]; rq = new_all[1]; rinit = new_all[2:];
@@ -1305,9 +1321,9 @@ def MathieuSin(a='a',q='q'):
         DD-finite implementation of the Mathieu Sine function.
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/28.2
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Mathieu_function
-            - http://mathworld.wolfram.com/MathieuFunction.html
+       - https://dlmf.nist.gov/28.2
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Mathieu_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/MathieuFunction.html
             
         This is the sine function with the Mathieu equation (i.e., with initial values
         0 an 1). It is equivalent to MathieuD(a,q,(0,1)).
@@ -1320,9 +1336,9 @@ def MathieuCos(a='a',q='q'):
         DD-finite implementation of the Mathieu Cosine function.
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/28.2
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Mathieu_function
-            - http://mathworld.wolfram.com/MathieuFunction.html
+       - https://dlmf.nist.gov/28.2
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Mathieu_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/MathieuFunction.html
             
         This is the cosine function with the Mathieu equation (i.e., with initial values
         1 an 0). It is equivalent to MathieuD(a,q,(1,0)).
@@ -1336,8 +1352,8 @@ def MathieuH(a='a',q='q',init=()):
         DD-finite implementation of the Modified Matheiu functions.
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/28.20
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Mathieu_function
+       - https://dlmf.nist.gov/28.20
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Mathieu_function
             
         The Modified Mathieu functions are the solutions to the DD-finite differential equation
             f'' - (a - 2qcosh(2x))f = 0.
@@ -1346,9 +1362,9 @@ def MathieuH(a='a',q='q',init=()):
         sinh and cosh (for q=0, a=1), and have several physical aplications.
         
         INPUT:
-            - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - q: the parameter 'q' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'q' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - q: the parameter 'q' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'q' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
     '''
     parent, new_all = __check_list([a,q] + list(init), [str(el) for el in DFinite.variables()]);
     ra = new_all[0]; rq = new_all[1]; rinit = new_all[2:];
@@ -1367,8 +1383,8 @@ def MathieuSinh(a='a',q='q'):
         DD-finite implementation of the Modified Matheiu functions.
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/28.20
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Mathieu_function
+       - https://dlmf.nist.gov/28.20
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Mathieu_function
             
         This is the hyperbolic sine function with the Mathieu equation (i.e., with initial values
         0 an 1). It is equivalent to MathieuH(a,q,(0,1)).
@@ -1381,8 +1397,8 @@ def MathieuCosh(a='a',q='q'):
         DD-finite implementation of the Modified Matheiu functions.
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/28.20
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Mathieu_function
+       - https://dlmf.nist.gov/28.20
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Mathieu_function
             
         This is the hyperbolic cosine function with the Mathieu equation (i.e., with initial values
         1 an 0). It is equivalent to MathieuH(a,q,(1,0)).
@@ -1396,9 +1412,9 @@ def HillD(a='a',q='q',init=()):
         DD-finite implementation of the Hill equation.
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/28.29
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Hill_differential_equation
-            - http://mathworld.wolfram.com/HillsDifferentialEquation.html
+       - https://dlmf.nist.gov/28.29
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Hill_differential_equation
+       - http://mathworld.wolfram.com/HillsDifferentialEquation.html
             
         The Hill differential equation is defined as
             f'' + (a + q(x))f = 0
@@ -1411,9 +1427,9 @@ def HillD(a='a',q='q',init=()):
         any DDFunction of any depth.
         
         INPUT:
-            - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - q: the parameter 'q' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'q' by default. This argument can be any DDFunction, rational number or any polynomial expression, which all variables (except 'x') will be considered as parameters.
-            - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - q: the parameter 'q' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'q' by default. This argument can be any DDFunction, rational number or any polynomial expression, which all variables (except 'x') will be considered as parameters.
+       - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
     '''
     if(is_DDFunction(q)):
         destiny_ring = q.parent().to_depth(q.parent().depth());
@@ -1449,9 +1465,9 @@ def AiryD(init=()):
         D-finite implementation of the Airy's functions (Ai(x), Bi(x)).
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/9.2
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Airy_function
-            - http://mathworld.wolfram.com/AiryFunctions.html
+       - https://dlmf.nist.gov/9.2
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Airy_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/AiryFunctions.html
             
         The Airy functions are the solutions of the differential equation:
             f'' - xf = 0
@@ -1470,7 +1486,7 @@ def AiryD(init=()):
         using the gamma function and the transcendental value pi.
         
         INPUT:
-            - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
     '''
     parent, rinit = __check_list(list(init), [str(el) for el in DFinite.variables()]);
     
@@ -1515,18 +1531,18 @@ def ParabolicCylinderD(a='a',b='b',c='c', init=()):
         D-finite implementation of Parabolic Cylinder functions.
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/12.2
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Parabolic_cylinder_function
-            - http://mathworld.wolfram.com/ParabolicCylinderDifferentialEquation.html
+       - https://dlmf.nist.gov/12.2
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Parabolic_cylinder_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/ParabolicCylinderDifferentialEquation.html
             
         The parabolic cylinder function is a solution to the differential equation:
             f'' + (c + bx + ax^2)f = 0
             
         INPUT:
-            - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - b: the parameter 'b' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'b' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - c: the parameter 'c' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'c' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - b: the parameter 'b' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'b' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - c: the parameter 'c' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'c' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
     '''
     parent, new_all = __check_list([a,b,c]+list(init), [str(el) for el in DFinite.variables()]);
     ra = new_all[0]; rb = new_all[1]; rc = new_all[2]; rinit = new_all[-len(init):];
@@ -1546,19 +1562,19 @@ def EllipticLegendreD(kind,var='phi'):
         DD-finite implementation of the Legendre elliptic integrals (F(phi,k), E(phi,k), D(phi,k)
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/19.2
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Legendre_form
-            - http://mathworld.wolfram.com/EllipticIntegraloftheFirstKind.html & http://mathworld.wolfram.com/EllipticIntegraloftheSecondKind.html & http://mathworld.wolfram.com/EllipticIntegraloftheThirdKind.html
+       - https://dlmf.nist.gov/19.2
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Legendre_form
+       - http://mathworld.wolfram.com/EllipticIntegraloftheFirstKind.html & http://mathworld.wolfram.com/EllipticIntegraloftheSecondKind.html & http://mathworld.wolfram.com/EllipticIntegraloftheThirdKind.html
             
         Given a function s(t) such that s^2 is a cubic or quartic polynomial in t and r(s,t) a rational function on s and t, 
         then the integral of r(s,t) w.r.t. t is calles an elliptic integral. The Legendre elliptic integral are obtained from
         the following functions:
         
-            - First kind:
+       - First kind:
                 s^2(t) = (1-t^2)(1-k^2t^2), r(s,t) = 1/s --> F(phi,k) = int_{0}^{sin(phi)} r(s,t).
-            - Second kind:
+       - Second kind:
                 s^2(t) = (1-t^2)(1-k^2t^2), r(s,t) = s/(1-t^2) --> E(phi,k) = int_{0}^{sin(phi)} r(s,t).
-            - Third kind:
+       - Third kind:
                 s^2(t) = (1-t^2)(1-k^2t^2), r(s,t) = t^2/s --> D(phi,k) = (F(phi,k)-E(phi,k))/k^2.
                 
         These elliptic functions (called incomplete Legendre integrals) satisfies differential equations w.r.t. both k and phi.
@@ -1569,8 +1585,8 @@ def EllipticLegendreD(kind,var='phi'):
         parameter for the differential equation.
         
         INPUT:
-            - kind: determines the kind of the Legendre elliptic integral the user will get. Can only take the values 1,2 or 3 and MUST be provided.
-            - var: the variable to consider. If str(var) is 'k', then the compelte Legendre elliptic integral is returned. If it is 'phi' (as it is by default) then the incomplete Legendre elliptic integral is returned with k as a parameter.
+       - kind: determines the kind of the Legendre elliptic integral the user will get. Can only take the values 1,2 or 3 and MUST be provided.
+       - var: the variable to consider. If str(var) is 'k', then the compelte Legendre elliptic integral is returned. If it is 'phi' (as it is by default) then the incomplete Legendre elliptic integral is returned with k as a parameter.
     '''
     if(kind not in [1,2,3]):
         raise ValueError("The kind of legendre elliptic integral is not valid. Required 0,1 or 2");
@@ -1610,26 +1626,26 @@ def CoulombSpheroidalFunctionD(a='a', b='b', c='c', d='d', kind = 1, init=()):
         D-finite implementation of the Coulomb speroidal function 
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/30.12
+       - https://dlmf.nist.gov/30.12
             
         This method retrieves the Coulomb Spheroidal Wave function that is a generalization of the Spheroidal Wave 
         function (see documentation of SpheroidalWaveFunctionD). This function adds a new parameter (d). There are
         two kinds of generalizations (both catched vy this function with the argumen 'kind'). They satisfy 
         the following differential equation:
-            - First kind:
+       - First kind:
                 ((1-x^2)f')' + (a + dx + b^2(1-x^2) - c^2/(1-x^2))f = 0
-            - Second kind:
+       - Second kind:
                 ((1-x^2)f')' + (a+ b^2(1-x^2) - d(d+1)/x^2 - c^2/(1-x^2))f = 0
                 
         Both equations reduce to the Spheroidal Wave differential equation when d=0.
         
         INPUT:
-            - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - b: the parameter 'b' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'b' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - c: the parameter 'c' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'c' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - d: the parameter 'd' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'd' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - kind: the kind of Coulomb Spheroidal function. Currently this can take the value 1 or 2 (1 by default).
-            - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - b: the parameter 'b' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'b' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - c: the parameter 'c' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'c' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - d: the parameter 'd' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'd' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - kind: the kind of Coulomb Spheroidal function. Currently this can take the value 1 or 2 (1 by default).
+       - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
     '''
     if(kind not in [1,2]):
         raise TypeValue("Generalized Spheroidal functions only allowed in two different generalizations (1 or 2). Got %s" %kind);
@@ -1656,9 +1672,9 @@ def SpheroidalWaveFunctionD(a='a', b='b', c='c', init=()):
         D-finite implementation of the spheroidal wave function.
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/30.2
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Spheroidal_wave_function
-            - http://mathworld.wolfram.com/SpheroidalWaveFunction.html
+       - https://dlmf.nist.gov/30.2
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Spheroidal_wave_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/SpheroidalWaveFunction.html
             
         The Spheroidal Wave functions are the solutions to the differential equation
             ((1-x^2)f')' + (a + b^2*(1-x^2) - c^2/(1-x^2))f = 0.
@@ -1669,10 +1685,10 @@ def SpheroidalWaveFunctionD(a='a', b='b', c='c', init=()):
         with a set of initial values.
         
         INPUT:
-            - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - b: the parameter 'b' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'b' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - c: the parameter 'c' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'c' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - b: the parameter 'b' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'b' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - c: the parameter 'c' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'c' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
     '''
     parent, new_all = __check_list([a,b,c]+list(init), [str(el) for el in DFinite.variables()]);
     ra = new_all[0]; rb = new_all[1]; rc = new_all[2]; rinit = new_all[-len(init):];
@@ -1695,7 +1711,7 @@ def FuschianD(a = (), gamma = (), q = (), init=()):
         D-finite implementation of the Fuschian equation
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/31.15
+       - https://dlmf.nist.gov/31.15
             
         The Fuschian differential equation is defined using three list of parameters of the same length
         a,gamma and q with the following formula:
@@ -1711,10 +1727,10 @@ def FuschianD(a = (), gamma = (), q = (), init=()):
         of method HeunD) when len(a) = 3, and the parameters are appropriately addapted.
         
         INPUT:
-            - a: a TUPLE with the values for the singularity parameter. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - gamma: a TUPLE with the exponents values. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - q: a TUPLE with the accesory parameters for the equation. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - a: a TUPLE with the values for the singularity parameter. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - gamma: a TUPLE with the exponents values. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - q: a TUPLE with the accesory parameters for the equation. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - init: a TUPLE with the initial values for the function. Each element can be a string to create a variable, any rational number or any polynomial expression which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
     '''
     ## Checking parameters
     if (not (isinstance(a,list) or isinstance(a,set) or isinstance(a,tuple))):
@@ -1759,9 +1775,9 @@ def HeunD(a='a',b='b',d='d',g='g',e='e',q='q'):
         D-finite implementation of the Heun's functions.
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/31.2
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Heun_function
-            - http://mathworld.wolfram.com/HeunsDifferentialEquation.html
+       - https://dlmf.nist.gov/31.2
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Heun_function
+       - http://mathworld.wolfram.com/HeunsDifferentialEquation.html
             
         Heun functions are the solutions of the differential equation
             f'' + (g/x + d/(x-1) + e/(x-a))f' + (Abx - q)/(x(x-1)(x-a)) f = 0,
@@ -1774,15 +1790,15 @@ def HeunD(a='a',b='b',d='d',g='g',e='e',q='q'):
         and q is called the "accesory parameter".
         
         INPUT:
-            - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - b: the parameter 'b' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'b' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - d: the parameter 'd' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'd' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - g: the parameter 'g' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'g' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - e: the parameter 'e' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'e' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - q: the parameter 'q' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'q' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - a: the parameter 'a' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'a' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - b: the parameter 'b' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'b' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - d: the parameter 'd' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'd' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - g: the parameter 'g' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'g' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - e: the parameter 'e' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'e' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - q: the parameter 'q' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'q' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
             
         WARNING:
-            - This method does not compute initial values for the solution of this differential equation as no power series solution is guaranteed due to the singularity at 0.
+       - This method does not compute initial values for the solution of this differential equation as no power series solution is guaranteed due to the singularity at 0.
     '''
     parent, new_all = __check_list([a,b,d,g,e,q], [str(el) for el in DFinite.variables()]);
     ra,rb,rd,rg,re,rq = new_all;
@@ -1798,8 +1814,8 @@ def CoulombF(m='m', l='l'):
         D-finite implementation of the regular Coulomb wave function (F_l(mu,ro)).
         
         References:
-            - https://dlmf.nist.gov/33.2
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Coulomb_wave_function
+       - https://dlmf.nist.gov/33.2
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Coulomb_wave_function
             
         The Coulomb Wave function is the solution to the differential equation
             f'' + (1-(2m)/x - (l(l+1))/x^2)f = 0
@@ -1808,8 +1824,8 @@ def CoulombF(m='m', l='l'):
         with first sequence element 1.
         
         INPUT:
-            - m: the parameter 'm' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'm' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
-            - l: the parameter 'l' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'l' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - m: the parameter 'm' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'm' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
+       - l: the parameter 'l' on the differential equation. If not provided, it takes the value 'l' by default. This argument can be any rational number or any polynomial expression, which variables will be considered as parameters (so 'x' is not allowed).
     '''
     parent, new_all = __check_list([m,l], [str(el) for el in DFinite.variables()]);
     rm, rl = new_all;
@@ -1842,7 +1858,7 @@ def Catalan():
         Implementation using DDFunctions of the generating function for Catalan numbers.
 
         References:
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Catalan_number
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Catalan_number
 
         The Catalan sequence is defined with a closed formula `c_n = binomial(2n,n)/(n+1)`. It has been widely studied 
         and it is known that this sequence satisfies a linear recurrence:
@@ -1861,8 +1877,8 @@ def Fibonacci(init=(0,1)):
         Implementation using DDFunctions of the generating function for the Fibonacci sequence.
 
         References:
-            - https://oeis.org/A000045
-            - https://en.wikipedia.org/wiki/Fibonacci_number
+       - https://oeis.org/A000045
+       - https://en.wikipedia.org/wiki/Fibonacci_number
 
         The Fibonacci sequence $(f_n)_n$ is defined classically with the linear recurrence
         $$f_{n+2} = f_{n+1} + f_{n},$$
@@ -1909,23 +1925,23 @@ def DAlgebraic(polynomial, init=[], dR=None):
         Method that transform an algebraic function to a DD-Function.
                 
         INPUT:
-            - polynomial: the minimal polynomial of the function we want to transform.
-            - init: the initial values that the function will have. Two options are 
+       - polynomial: the minimal polynomial of the function we want to transform.
+       - init: the initial values that the function will have. Two options are 
             possible: a list is given, then we will use it directly to build the final 
             result, or a value is given an we will compute the others using the polynomial 
             equation.
-            - dR: the ring where we want to include the result. If None, an automatic 
+       - dR: the ring where we want to include the result. If None, an automatic 
             destiny ring will be computed.
             
         OUTPUT:
-            - A DDFunction in a particuar DDRing.
+       - A DDFunction in a particuar DDRing.
             
         WARNINGS:
-            - There is no control about the irreducibility of the polynomial.
+       - There is no control about the irreducibility of the polynomial.
             
         ERRORS:
-            - If the function can not be represented in dR a TypeError will be raised
-            - If any error happens with the initial values, a ValueError will be raised
+       - If the function can not be represented in dR a TypeError will be raised
+       - If any error happens with the initial values, a ValueError will be raised
     '''
     ## Local imports
     from sage.rings.polynomial.polynomial_ring import is_PolynomialRing as isPolynomial;
@@ -2128,14 +2144,14 @@ def __decide_parent(input, parent = None, depth = 1):
         as the coefficient of a differential equation.
         
         If 'parent' is None, then several considerations are made:
-            - If 'input' is a Symbolic Expression, we take the variables of it, consider 
+       - If 'input' is a Symbolic Expression, we take the variables of it, consider 
             everyone but 'x' as parameters and create the corresponding ParametrizedDDRing 
             of the depth given. The argument 'input' MUST be a polynomial in 'x' and a 
             rational function in any other variable.
-            - If 'input' is a polynomial, then the first generator will be consider as the 
+       - If 'input' is a polynomial, then the first generator will be consider as the 
             variable of a DDRing and the others as parameters. Then we create the corresponding
             ParametrizedDDRing with the depth given.
-            - Otherwise, we create the DDRing of the parent of 'input' of the given depth 
+       - Otherwise, we create the DDRing of the parent of 'input' of the given depth 
             and try to work with that ring.
     '''
     dR = parent;
@@ -2170,9 +2186,9 @@ def __check_list(list_of_elements, invalid_vars=[]):
         to appear in the elements, raising an error if that happens.
         
         The elements on the list can be:
-            - A string: it will be consider as the name of a parameter.
-            - Any element with attribute 'variables'. All the variables found will be add as parameters.
-            - Elements of a FractionField. The base ring must provide the method 'variables'. All the variables found will be added as parameters.
+       - A string: it will be consider as the name of a parameter.
+       - Any element with attribute 'variables'. All the variables found will be add as parameters.
+       - Elements of a FractionField. The base ring must provide the method 'variables'. All the variables found will be added as parameters.
             
         Once all the variables are computed, we checked that there are no invalid variables and then we 
         build the field of rational functions in the variables found. Then we return this field together 
index f8b71d4..55df89a 100644 (file)
@@ -1,3 +1,35 @@
+r"""
+Python file for lazy implementation of a DDRing
+
+This package provides the implementation of a DDRing which elements perform lazily all the possible operations.
+
+
+EXAMPLES::
+
+    sage: from ajpastor.dd_functions import *
+    sage: DFinite
+    DD-Ring over (Univariate Polynomial Ring in x over Rational Field)
+
+TODO::
+       * Make the EXAMPLES section in this documentation
+       * Document the package
+       * Review the package functionality
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-01-29): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
 # This file was *autogenerated* from the file ./lazyRing.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
index 8e7e773..70ec2e6 100644 (file)
@@ -1,4 +1,36 @@
+r"""
+Python file for symbolic DDFunctions
 
+This package provides all the functionality to manage the DDFunction as symbolic expressions and viceversa,
+being able to build DDFunctions from Symbolic Expressions when the functions employed are in the library
+ddExamples.
+
+EXAMPLES::
+
+    sage: from ajpastor.dd_functions import *
+    sage: DFinite
+    DD-Ring over (Univariate Polynomial Ring in x over Rational Field)
+
+TODO::
+       * Do the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Check the functionality of the package
+       
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 # This file was *autogenerated* from the file ./symbolic.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
index 7eddad5..39d06a4 100644 (file)
@@ -1,4 +1,34 @@
-   
+r"""
+Python file for DDFunctions as DA-Functions
+
+This package provides functions to work with DDFunctions as differentially algebraic functions.
+
+EXAMPLES::
+
+    sage: from ajpastor.dd_functions import *
+    sage: DFinite
+    DD-Ring over (Univariate Polynomial Ring in x over Rational Field)
+    
+TODO::
+       * Do the examples section of this documentation
+       * Document this package
+       * Review the functionality of this package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************   
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 from sage.graphs.digraph import DiGraph;
index e689411..bb37392 100644 (file)
@@ -1,3 +1,32 @@
+r"""
+Package lazy
+
+In this package the user may find the following subpackages:
+* conversion: definition of a ConversionSystem
+* lazyToPoly: conversion system based on a variable Polynomial Ring
+* lazyRing: conversion system based on a ring using the basics of lazyToPoly
+* lazyIDElements: the element class for lazyRing
+* lazyFracField: conversion system based on a Fraction Field using the basics of lazyToPoly
+
+TODO::
+       * Review the import statements of this package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
+
 from lazyToPoly import LazyToPoly;
 
 from pkgutil import extend_path;
index 7c3f173..d19ed3e 100644 (file)
@@ -1,5 +1,34 @@
+r"""
+Python file for a conversion system.
+
+A conversion system is just a polynomial ring where the variables has a meaning. Using this conversion system
+one can perform operations in the polynomial setting, discover relations between the variables and get the
+final result in the appropriate context.
+        
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.lazy.conversion
+
+TODO::
+       * Do the examples section in this documentation
+       * Document all the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./conversion.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0)
index 4a156f2..901c510 100644 (file)
@@ -1,5 +1,32 @@
+r"""
+Python file for a Lazy Fraction Field
+
+This module implements a conversion system based on a Fraction Field. This requires a Lazy Integral Domain.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.lazy.lazyFracField
+
+TODO::
+       * Do the examples section in this documentation
+       * Document all the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./lazyFracField.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_2 = Integer(2); _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0); _sage_const_25 = Integer(25)
index 790ec61..9c5c8a5 100644 (file)
@@ -1,5 +1,34 @@
+r"""
+Python file for Integral Domain Elements for LazyRings
+
+This module provides the implementation of the Element class for LazyRings
+based on Integral Domains. It contains all the arithmetic functionality
+required to make it work with linear algebra algorithms.
+        
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.lazy.lazyIDElements
+
+TODO::
+       * Do the examples section in this documentation
+       * Document all the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./lazyIDElements.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_2 = Integer(2); _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_10 = Integer(10); _sage_const_0 = Integer(0); _sage_const_20 = Integer(20)
index 9d7d4a9..511bc41 100644 (file)
@@ -1,5 +1,35 @@
+r"""
+Python file for LazyRing
+
+This module implements all tjhe functionality of a ConversionSystem based on a Ring using 
+lazy operations. This means all the arithmetic operations are done in a polynomial ring.
+This structure also increase the number of variables employed in the polynomial ring
+as the suer require to represent more elements of the ring.
+        
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.lazy.lazyRing
+
+TODO::
+       * Do the examples section in this documentation
+       * Document all the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./lazyRing.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 from sage.rings.ring import IntegralDomain;
index f737305..0d7232c 100644 (file)
@@ -1,5 +1,34 @@
+r"""
+Python file an abstract class LazyToPoly. 
+
+This module includes the abstract basic definition of any ConversionSystem that use as basis computations
+a variable polynomial ring which variables increase under demand of the user. It performs several simplifications
+to avoid adding too many (unnecessary) variables.
+        
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.lazy.lazyToPoly
+
+TODO::
+       * Do the examples section in this documentation
+       * Document all the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./lazyToPoly.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0)
index 13bfa9e..7e91c74 100644 (file)
@@ -1,3 +1,32 @@
+r"""
+Package misc
+
+In this package the user may find the following subpackages:
+* bareiss: an implementation of the Bareiss algorithm for getting nullspaces of matrices over Integral Domains
+* cached_property: implementation of a decorator to declared derived attributes of objects
+* dinamic_string: implementation of an enhanced string where it can be built from different pieces
+* exceptions: basic Exceptions for general use
+* matrix: basic operations and utilities with matrices and linear algebra
+* restore: implementation of a restore system
+* ring_w_sequence: implementation of a Ring class where their elements define a sequence
+* sequence_manipulation: module with method to manipulate sequences in black-box format
+* verbose: an implementation of a verbose system for debugging or control
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 from pkgutil import extend_path;
 __path__ = extend_path(__path__, __name__);
 
index 9139d20..c1471fb 100644 (file)
@@ -1,3 +1,32 @@
+r"""
+Python file for a Bareiss algorithm
+
+This module offers an implementation of Bareiss algorithm. Such algorithm computes the right nullspace of a matrix where its coefficients
+belong to an Integral Domain. This algorithm is division-free.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.misc.bareiss import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
 from sage.all import *   # import sage library
 
index b9dcab5..9e6e2f7 100644 (file)
@@ -1,6 +1,34 @@
+r"""
+Python file for a dynamic string
+
+This module offers an implementation of a class (DinamicString) that behaves like a string 
+but can be built using different common pieces so it is possible to perform simultaneos
+substitutions on the string.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.misc.dinamic_string import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-################################################################################
-################################################################################
 ################################################################################
 ### Class DinamicString
 class DinamicString(object):
index 02059c3..eeea777 100644 (file)
@@ -1,3 +1,32 @@
+r"""
+Python file for general exceptions
+
+This module offers several Exceptions for general purposes.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.misc.exceptions import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
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+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
+
 class DebugError(RuntimeError):
     '''
         Error meaning an unexpected error in the code. Future versions should fix it.
index 93ac2c8..564ebc7 100644 (file)
@@ -1,3 +1,32 @@
+r"""
+Python file for matrix operations and utilities
+
+This module offers several methods to build matrices and operate with them in a very general fashion.
+It also provides several method for differential linear algebra.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.misc.matrix import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
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+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
 from sage.all import *   # import sage library
 
index 4cdd5b4..64713dc 100644 (file)
@@ -1,3 +1,32 @@
+"""
+Python file for linear restoring the system
+
+This module provides a bunch of methods to save and restore the state of the Python session.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.misc.restore import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
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+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
+
 ##########################################
 ###
 ### RESTORING SESSION METHODS
index 00ecb9e..e321044 100644 (file)
@@ -1,3 +1,32 @@
+"""
+Python file for Ring with Sequences
+
+This module implements a Ring Parent structure in Sage such that all its elements define a sequence in some space. This
+implies that the elements of a Ring with Sequence must provide a method (getSequenceElement).
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.misc.ring_w_sequence import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
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+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
 from sage.all import *   # import sage library
 
index 72b3ba3..3d6466d 100644 (file)
@@ -1,3 +1,34 @@
+"""
+Python file for sequence manipulations
+
+This module provides several methods for manipulating sequences in a black-box format, i.e., when the
+sequence is given as a function that recieves the index and returns the corresponding element
+of the sequence.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.sequence_manipulation import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
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+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
+
 from sage.functions.other import factorial;
 from sage.combinat.combinat import bell_polynomial;
 from sage.arith.misc import falling_factorial;
index a4b3b19..e900f35 100644 (file)
@@ -1,3 +1,32 @@
+"""
+Python file for verbose system
+
+This module offers a verbose system for helping debugging, tracking procceses or whatever the user want to 
+print. It provides an indentation system, depth of printing and many other utilities.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.misc.verbose import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
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+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
 from sage.all import *   # import sage library
 
index 00cbfa0..d79b412 100644 (file)
@@ -1,3 +1,32 @@
+r"""
+Package operator
+
+In this package the user may find the following subpackages:
+* operator: basic class for linear differential operators
+* listOperator: abstract class of operator based on a list structure
+* oreOperator: class of operator wrapping the operators in ore_alebra
+* twoStepsOperator: abstract class of listOperator that performed operations in two steps
+* directStepOperator: implementation of twoStepsOperator
+* lazyStepOperator: implementation of twoStepsOperator (to review)
+* fullLazyOperator: implementation of twoStepsOperator with all operations lazily performed
+* polynomialLazyOperator: implementation of twoStepsOperator (to review)
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
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+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
+
 from .operator import Operator;
 from .oreOperator import w_OreOperator as OreOperator;
 from .directStepOperator import DirectStepOperator;
index c99f50b..608b6ff 100644 (file)
@@ -1,5 +1,32 @@
+r"""
+Python file for directStepOperator
+
+This module offers an implementarion of a TwoStepsOperator.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.operator.twoStepsOperator import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./directStepOperator.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0)
index b2b7f84..ed960ff 100644 (file)
@@ -1,5 +1,32 @@
+r"""
+Python file for fullLazyOperators
+
+This module offers an implementarion of a TwoStepsOperator where all the operations are performed lazily.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.operator.twoStepsOperator import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./fullLazyOperator.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0); _sage_const_5 = Integer(5)
index 02c923a..dc38d75 100644 (file)
@@ -1,5 +1,36 @@
+r"""
+Python file for lazyStepOperators
+
+This module offers an implementarion of a TwoStepsOperator where the companion matrix is computed lazily, and
+hence, the computation of the matrix is lazy. However, the computation of the final nullspace is performed
+with all the operations.
+
+**This package need a huge review**
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.operator.lazyStepOperator import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./lazyStepOperator.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_3 = Integer(3); _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0)
index 78b0cb4..f46f145 100644 (file)
@@ -1,5 +1,31 @@
+r"""
+Python file for TwoSteps Operators
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./listOperator.sage
+This module offers an abstract class of linear differential operators which basic structure is a list of coefficients.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.operator.listOperator import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_3 = Integer(3); _sage_const_2 = Integer(2); _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0)
index 830eba5..c1d5c04 100644 (file)
@@ -1,5 +1,32 @@
+r"""
+Python file for linear differential operator
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./operator.sage
+This module offers an abstract class of linear differential operators giving a general interface for being used
+independently of the implementation.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.operator.operator import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0)
index 450228e..7a313a6 100644 (file)
@@ -1,5 +1,34 @@
+r"""
+Python file for Ore Operators
+
+This module offers an implementation of an linear differential operator based on the implementation on the package ore_algebra
+by Manuel Kauers and Marc Mezzaroba. This class is a simply wrapper putting a common interface from the ore operators with
+the other operators provided in ajpastor.operator.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.operator.oreOperator import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./oreOperator.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0)
index 42c8302..c1f4801 100644 (file)
@@ -1,5 +1,34 @@
+r"""
+Python file for Polynomial Lazy Operators
+
+This module offers an implementation of a TwoStepsOperator using lazy operations with polynomials.
+
+**This module requires a huge review**
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.operator.polynomialLazyOperator import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./polynomialLazyOperator.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0); _sage_const_4 = Integer(4)
index 1369eb6..dfb8be7 100644 (file)
@@ -1,5 +1,35 @@
+r"""
+Python file for TwoSteps Operators
+
+This module offers an abstract class of linear differential operators which its linear algebra operations
+are performed in two different steps: 
+* Computing a matrix
+* Getting an element of its nullspace.
+
+EXAMPLES::
+       sage: from ajpastor.operator.twoStepsOperator import *
+
+TODO::
+       * Complete the Examples section of this documentation
+       * Document the package
+       * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./twoStepsOperator.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0)
index e69de29..bc3f36c 100644 (file)
@@ -0,0 +1,21 @@
+r"""
+Package tests
+
+In this package the user may find the following subpackages:
+* dd_functions: several tests for the package ajpastor.dd_functions
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
\ No newline at end of file
index 2daee45..dc017c4 100644 (file)
@@ -1,3 +1,26 @@
+r"""
+Package dd_functions
+
+This package provides the tests for the package ajpastor.dd_functions. The user can run all the tests in a row
+using the provided function ``run`` in this package. Otherwise, the user must import each of the modules and execute
+the ``run``method on each of them.
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
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+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
+
 def run():
     __LIST_OF_FILES = ["ddFunction", "ddFunction2", "examples", "identities", "hypergeometric", "chebyshev", "bessel"];
     
index bf018d6..2a7a34c 100644 (file)
@@ -1,3 +1,31 @@
+r"""
+Python file for a basic test
+
+This module is not inteded to be executed. This is a basic blueprint for further test files.
+
+EXAMPLES::
+    sage: from ajpastor.tests.dd_functions.base_test import *
+
+TODO::
+    * Complete the Examples section of this documentation
+    * Document the package
+    * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
 # This file was *autogenerated* from the file ./dd_functions/identities.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
index d1113fb..03fd881 100644 (file)
@@ -1,5 +1,32 @@
+r"""
+Python file for a tests using bessel functions
+
+This module test the equalities referring to the Bessel Functions.
+
+EXAMPLES::
+    sage: from ajpastor.tests.dd_functions.bessel import *
+
+TODO::
+    * Complete the Examples section of this documentation
+    * Document the package
+    * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./dd_functions/bessel.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_2 = Integer(2); _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_20 = Integer(20); _sage_const_4 = Integer(4)########################################################################
index db2c435..a7313a6 100644 (file)
@@ -1,5 +1,32 @@
+r"""
+Python file for a tests using chebyshev polynomials
+
+This module test the equalities referring to the Chebyshev Polynomials.
+
+EXAMPLES::
+    sage: from ajpastor.tests.dd_functions.chebyshev import *
+
+TODO::
+    * Complete the Examples section of this documentation
+    * Document the package
+    * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./dd_functions/chebyshev.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_2 = Integer(2); _sage_const_20 = Integer(20); _sage_const_0 = Integer(0); _sage_const_1 = Integer(1)########################################################################
index dd3e40b..e919724 100644 (file)
@@ -1,5 +1,32 @@
+r"""
+Python file for a tests the DDFunctions
+
+This module test the basic properties and methods of DDFunctions.
+
+EXAMPLES::
+    sage: from ajpastor.tests.dd_functions.ddFunction import *
+
+TODO::
+    * Complete the Examples section of this documentation
+    * Document the package
+    * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./dd_functions/ddFunction.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_3 = Integer(3); _sage_const_2 = Integer(2); _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0); _sage_const_6 = Integer(6); _sage_const_4 = Integer(4); _sage_const_8 = Integer(8); _sage_const_10 = Integer(10); _sage_const_16 = Integer(16); _sage_const_32 = Integer(32)
index 40801b5..3966a29 100644 (file)
@@ -1,5 +1,32 @@
+r"""
+Python file for a tests using DDFunctions
+
+This module test the construction of DDRings.
+
+EXAMPLES::
+    sage: from ajpastor.tests.dd_functions.ddFunction2 import *
+
+TODO::
+    * Complete the Examples section of this documentation
+    * Document the package
+    * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./dd_functions/ddFunction2.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_3 = Integer(3); _sage_const_2 = Integer(2); _sage_const_9 = Integer(9); _sage_const_0 = Integer(0)
index 251fc53..514eb8b 100644 (file)
@@ -1,5 +1,32 @@
+r"""
+Python file for a tests the module ajpastor.dd_functions.ddExamples
+
+This module test the examples provided in ajpastor.dd_functions.ddExamples that are not covered in other tests.
+
+EXAMPLES::
+    sage: from ajpastor.tests.dd_functions.examples import *
+
+TODO::
+    * Complete the Examples section of this documentation
+    * Document the package
+    * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./dd_functions/examples.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_3 = Integer(3); _sage_const_2 = Integer(2); _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_0 = Integer(0); _sage_const_4 = Integer(4); _sage_const_8 = Integer(8); _sage_const_10 = Integer(10)
index 17fc7c3..493af06 100644 (file)
@@ -1,5 +1,32 @@
+r"""
+Python file for a tests using hypergeometric functions
+
+This module test the equalities referring to the Hypergeometric Functions.
+
+EXAMPLES::
+    sage: from ajpastor.tests.dd_functions.hypergeometric import *
+
+TODO::
+    * Complete the Examples section of this documentation
+    * Document the package
+    * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
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+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./dd_functions/hypergeometric.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_3 = Integer(3); _sage_const_2 = Integer(2); _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_10 = Integer(10); _sage_const_4 = Integer(4)########################################################################
index 527557f..8cf471d 100644 (file)
@@ -1,5 +1,32 @@
+r"""
+Python file for a tests on identities
+
+This module test several identities with DDFunctions.
+
+EXAMPLES::
+    sage: from ajpastor.tests.dd_functions.identities import *
+
+TODO::
+    * Complete the Examples section of this documentation
+    * Document the package
+    * Review the functionality of the package
+
+AUTHORS:
+
+    - Antonio Jimenez-Pastor (2016-10-01): initial version
+
+"""
+
+# ****************************************************************************
+#  Copyright (C) 2019 Antonio Jimenez-Pastor <ajpastor@risc.uni-linz.ac.at>
+#
+# This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+# it under the terms of the GNU General Public License as published by
+# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+# (at your option) any later version.
+#                  https://www.gnu.org/licenses/
+# ****************************************************************************
 
-# This file was *autogenerated* from the file ./dd_functions/identities.sage
 from sage.all_cmdline import *   # import sage library
 
 _sage_const_3 = Integer(3); _sage_const_2 = Integer(2); _sage_const_1 = Integer(1); _sage_const_10 = Integer(10); _sage_const_0 = Integer(0)